Доброго времени дня!
Вопрос: Как запустить приложние или другой файл, через тег <a href... чтобы он запустился как приложение - допустим через ссылку - вызвать любой док или ексель файл?

А вот никак.
Запустить ворд по ссылке <a href=...> можно лишь одним способом.
Подвешиваем на ссылку файл типа .doc.
Пользователь скачивает файл и открывает его.

А может вым надо что-то другое? docs.google.com

Можно, если дать прямую ссылку на документ, где он лежит у юзверя, и юзер сам откроет его в своем браузере. Т.е. страница должна быть запущена юзером со своего домашнего компа, и находится там же. Для интереса посмотрите, как сделаны автораны AlexSoft