Установил поюзать программу Mozilla Thunderbird, до этого почтовыми программами не пользовался... Так вот, такая проблемка:
При загрузке новых сообщений выходит окно Предупреждения след содержания:
"Команда RETR не выполнена. Ошибка получения сообщения. Почтовый сервер pop.yandex.ru ответил unable to retrieve message, contact system administrator."

Подскажите пожалуйста, как его настроить? Где искать решение проблемы?

Какие ещё бесплатные программы можете посоветовать для работы с почтой?

Идешь на яндекс и читаешь руководство по настройке почтовых клиентов

Учетную запись то я сразу после установки создал, настройки обычные... Проблема в том что при первой загрузке, скачивая всё с веб-почты он выдал это сообщение, и выдает это окно предупреждение каждый раз при загрузке новых сообщений. Скачивает вроде всё...
Я не пойму чего он хочет, что не так?

Вот я и жду совета сис.админов...

Это при скачке только с Яндекс-почты?
Попробуй все переустановить и настройки делай руками, а не мастером.

Попробуй pop3.yandex.ru
Танцы с бубном, конечно, а вдруг?